挑戰教條主義:你認為重新排列染色體會影響它們的功能嗎?

【字體: 時間:2019年07月17日 來源:

編輯推薦:

  分子生物學家認為,基因組的三維組織結構控制基因的表達方式。但是現在,EMBL的研究人員在《Nature Genetics》發表的一項有關果蠅高度重排的染色體的研究卻對該“普遍性”提出了挑戰。他們的結果顯示,基因組3D組織(也稱染色質拓撲學)與基因表達之間是脫鉤的。

  

分子生物學家認為,基因組的三維組織結構控制基因的表達方式。但是現在,EMBL的研究人員在《Nature Genetics》發表的一項有關果蠅高度重排的染色體的研究卻對該“普遍性”提出了挑戰。他們的結果顯示,基因組3D組織(也稱染色質拓撲學)與基因表達之間是脫鉤的。


金字塔代表野生型染色質結構域,水中的倒影代表了突變果蠅染色體的重新排列

染色體被劃分為不同區域,控制基因表達的DNA調控區(所謂的增強子)通常位于與其靶基因相同的染色質域(或稱為拓撲相關域)。這里有許多有趣的例子,例如,限制增強子的活性只會限制其域內基因的表達。

為了更系統地檢驗這些發現的普遍性,EMBL的Furlong和Korbel課題組利用模式動物果蠅來研究高度重排的突變染色體。Yad Ghavi-Helm、Alek Jankowski和Sascha Meiers等人發現,染色質結構域的變化并不能預測基因組表達的變化。這意味著,除了域,還必須有其他機制來控制增強子與其靶基因之間相互作用的特異性。

動搖武斷的教理

領導這項研究的Eileen Furlong說:“這些結果對目前該領域的一個教條的普遍性提出了質疑,即染色質域(TADs)真的對抑制和限制增強子功能至關重要嗎?”

“我們的研究證明,大多數基因組3D組織變化對基因的表達幾乎沒有影響,至少在我們設計的生物學背景下。結果表明,雖然一些基因也會受到影響,但絕大多數基因似乎對染色質域的重排有抵抗力,而且只有一小部分基因對其拓撲結構的這種變化敏感。”

增強子沒你想的那么“隨意”

他們對染色質拓撲學提出了許多有趣的問題:那么除了3D組織結構,控制增強子與靶基因相互作用的其他機制是什么?許多增強子似乎不那么“隨意”,它們不是對任何基因都感興趣,而是有首選的伴侶。

研究小組將繼續利用遺傳學、光遺傳學和單細胞方法來干擾和分析,從而研究順式和反式染色質拓撲結構的影響。

原文檢索:Highly rearranged chromosomes reveal uncoupling between genome topology and gene expression

(生物通:伍松)

我來說兩句
0  條評論    0 人次參與
登錄 注冊發布
最新評論刷新
查看更多評論 > >
相關新聞
生物通微信公眾號
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 國際
  • 國內
  • 人物
  • 產業
  • 熱點
  • 科普
  • 急聘職位
  • 高薪職位

知名企業招聘

熱點排行

    新聞專題

    生物通首頁 | 今日動態 | 生物通商城 | 人才市場 | 核心刊物 | 特價專欄 | 儀器龍虎榜

    版權所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    聯系信箱:

    粵ICP備09063491號

    幸运飞艇最新群二维码